Aerobi obbligati

Cocchi Gram-negativi

Moraxella catarrhalis, Neisseria gonorrhoeae, N. meningitidis*

Bacilli Gram-positivi

Corynebacterium jeikeium

Bacilli acidoresistenti

Mycobacterium avium complex, M. kansasii, M. leprae, M. tuberculosis, Nocardia spp

Non fermentanti, non Enterobacterales

Acinetobacter calcoaceticus, Elizabethkingia meningoseptica (precedentemente Flavobacterium meningosepticum), Pseudomonas aeruginosa,* P. alcaligenes, altri Pseudomonas spp, Stenotrophomonas maltophilia

Coccobacilli e bacilli Gram-negativi molto esigenti

Brucella, Bordetella, Francisella, e Legionella spp

Leptospiraceae (batteri a spirale)

Leptospira spp

Anaerobi obbligati

Bacilli Gram-negativi

Bacteroides fragilis, altri Bacteroides spp, Fusobacterium spp, Prevotella spp

Cocchi Gram-negativi

Veillonella spp

Cocchi Gram-positivi

Peptococcus niger, Peptostreptococcus spp

Bacilli Gram-positivi non-sporigeni

Actinomyces, Bifidobacterium, Eubacterium, and Cutibacterium (precedentemente Propionibacterium) spp

Bacilli Gram-positivi formanti endospore

Clostridium botulinum, C. perfringens, C. tetani, altri Clostridium spp

Anaerobi facoltativi

Cocchi Gram-positivi, catalasi-positivi

Staphylococcus aureus (coagulasi-positivi), S. epidermidis (coagulasi-negativi), altri stafilococchi coagulasi-negativi

Cocchi Gram-positivi, catalasi-negativi

Enterococcus faecalis, E. faecium, Streptococcus agalactiae (streptococco del gruppo B), S. bovis, S. pneumoniae, S. pyogenes (streptococco di gruppo A), streptococchi del gruppo viridans (S. mutans, S. mitis, S. salivarius, S. sanguis), S. anginosus gruppo (S. anginosus, S. milleri, S. constellatus), Gemella morbillorum

Bacilli Gram-positivi

Bacillus anthracis, Erysipelothrix rhusiopathiae, Gardnerella vaginalis (gram-variabile)

Bacilli Gram-negativi

Enterobacterales (Citrobacter spp, Enterobacter spp, Escherichia coli, Klebsiella spp, Morganella morganii, Proteus spp, Plesiomonas shigelloides, Providencia rettgeri, Salmonella typhi, altro Salmonella spp, Serratia marcescens, Shigella spp, Yersinia enterocolitica, Y. pestis)

Fermentanti, non-Enterobacterales

Aeromonas hydrophila, Chromobacterium violaceum, Pasteurella multocida

Coccobacilli e bacilli Gram-negativi molto esigenti

Aggregatibacter (precedentemente Actinobacillus) actinomycetemcomitans, Eikenella corrodens, Haemophilus influenzae, altri Haemophilus spp

Micoplasma

Mycoplasma pneumoniae

Microaerofili

Bacilli ricurvi

Campylobacter jejuni, Helicobacter pylori, Vibrio cholerae, V. vulnificus

Spirochaetaceae (batteri a spirale)

Borrelia burgdorferi, Treponema pallidum

Parassita intracellulare obbligato

Chlamydiaceae

Chlamydia trachomatis, Chlamydophila pneumoniae, C. psittaci

Coxiellaceae

Coxiella burnetii

Rickettsiali

Rickettsia prowazekii, R. rickettsii, R. typhi, Orientia tsutsugamushi, Ehrlichia chaffeensis, Anaplasma phagocytophilum