La cornea può essere soggetta a infezioni, infiammazioni non infettive, ulcerazioni, danni meccanici e lesioni ambientali. L'infezione (cheratite), spesso associata a una congiuntivite secondaria, può essere dovuta a virus, batteri, Acanthamoeba o miceti. Un'ulcerazione di solito rappresenta la progressione di una cheratite. I sintomi che suggeriscono il coinvolgimento corneale piuttosto che la semplice congiuntivite comprendono il dolore (sensazione di corpo estraneo e dolore), in particolare con l'esposizione alla luce, e la diminuzione dell'acuità visiva.
La valutazione della cornea richiede l'esame con lampada a fessura e talora studi microbiologici.