قد تكون الأعضاءُ الهضمية غير مكتملة التخلُّق أو مُتموضِعة بشكلٍ غير طبيعيّ، ممّا يسبب حالات من الانسِداد، أو قد تكون هناك عُيوب في عضلات أو أعصاب السبيل الهضمي.
تستنِدُ الأعراض إلى موضع العيب، ولكنها قد تنطوي على ألمٍ ومغص وتورُّم في البطن وتقيُّؤ،
ويستند التَّشخيصُ عادةً إلى فُحوصات التصوير واختبارات أخرى.
تحتاج هذه الحالات إلى الجراحة عادةً.
يمكن أن يحدثَ العيب الخَلقي لمحة عامة عن العيوب الخلقيَّة العُيوب الخلقيَّة التي تُسمَّى الشذوذات الخلقية أيضًا، هي تشوُّهات بدنيَّة تحدُثُ قبل وِلادة الصغير،وتَكون واضحةً عادةً خلال العام الأوَّل من العُمر. لا يُعرف سَبب العديد من العيوب الخلقية،... قراءة المزيد في أي مكان على امتِداد السبيل الهضمي، أي في المريء الحلق والمري يتوضع الحلق (البلعوم) إلى الخلف والأسفل من الفم.تعبر الأطعمة عبر الحلق بعد مغادرتها للفم.تبدأ عملية بلع الأطعمة والسوائل بشكل إرادي ثم تستمر بشكل تلقائي.عند البلع، ينغلق المجرى الهوائي (الرغامى)... قراءة المزيد ، أو المعدة المعدة المعدة هي تجويف عضلي كبير بشكل حبة الفاصولياء، يتألف من أربع مناطق: فؤاد المعدة قاع المعدة الجسم مدخل المعدة قراءة المزيد ، أو المِعَى الدَّقيق الأمعاء الدقيقة يُعد الاثناعشرِي الجزء الأول من الأمعاء الدقيقة، والذي يصل الطعام إليه أولًا بعد خروجه من المعدة.يدخل الطعام إلى الاثناعشرِي بعد المرور عبر العاصرة البوابية مجزءاً على كميات ضئيلة يمكن للأمعاء... قراءة المزيد ، أو المِعَى الغليظ الأمعاء الغليظة تتألف الأمعاء الغليظة من الأعور والقولون النازل (الأيمن) القولون المعترض القولون النازل (الأيسر) القولون السيني (الذي يتصل بالمستقيم) قراءة المزيد ، أو المستقيم المستقيم والشرج المستقيم هو الحجرة التي تبدأ من نهاية الأمعاء الغليظة، وتلي القولون السيني بشكل مباشر، وتنتهي عند فتحة الشرج ( انظر أيضًا لمحة عامة عن الشَّرج والمستقيم).يكون المستقيم فارغاً في الحالة العادية،... قراءة المزيد ، أو الشرج المستقيم والشرج المستقيم هو الحجرة التي تبدأ من نهاية الأمعاء الغليظة، وتلي القولون السيني بشكل مباشر، وتنتهي عند فتحة الشرج ( انظر أيضًا لمحة عامة عن الشَّرج والمستقيم).يكون المستقيم فارغاً في الحالة العادية،... قراءة المزيد .تنطوي مثل هذه العيوبُ الخَلقية على:
عيوب جدار البطن عيوبُ جدار البطن (القِيلَة السُرِّيَّة والانشِقاقُ البَطنِي الخلقِيّ) بالنسبة إلى عيوب جدار البطن، تكون العضلات المحيطة بتجويف البطن ضعيفةً أو تحدث فيها ثُقوب، ممَّا يسمَح باندِلاق الأمعاء. وينطوي العيبان الرئيسيان في جدار البطن على القِيلَة السُرِّيَّة والانشِقاق... قراءة المزيد (بما في ذلك القِيلَة السُرِّيَّة omphalocele والانشِقاق البَطنِي الخلقِيّ gastroschisis)
رتق المريء Esophageal atresia والناسور الرغامي المريئي tracheoesophageal fistula رَتَقُ المَريء والناسور الرُغامِي المَريئِيّ رتق المريء هو عيب ولادي يتضيَّق فيه المريء أو يُصبح مسدودًا.كما يكُون أيضًا لدى معظم الأطفال حديثي الولادة الذين يعانون من رتق المريء وصلة غير طبيعية بين المريء والرُّغامَى تُسمَّى الناسور الرُغامِي... قراءة المزيد
رَتَق القَناةِ الصَّفراوِيَّة (عيب ولادي يؤثر في القنوات الصَّفراوِيَّة المَثانة والسبيل الصفراويّ المَرارة هي كيس تخزين عضليّ صغير الحجم على شكل ثمرة الإجاص تحتوي على الصفراء، وتكُون مترابطة مع الكبد بقنواتٍ تُسمَّى السبيل الصفراويّ.(انظر أيضًا لمحة عامة عن الكبد والمرارة). والصفراء هي سائل... قراءة المزيد 
).على الرغم من أن القنوات الصفراوية تتوضَع خارج السبيل الهضمي، إلا أنها تساعد على عملية الهضم، وبذلك فهي مذكورة في هذا الفصل.
وفي كثير من الحالات، لا يتخلق عضو ما بشكلٍ كامل أو يتموضع بشكلٍ غير طبيعي، ممَّا يُسبب غالبًا تضيُّقًا أو انسِدادًا.يمكن أن يكون الانسدادُ موجودًا في أي مكان تقريبًا في السبيل الهضمي، بما في ذلك المريءُ، أو الأمعاء، أو المستقيم، أو الشرج.في بعض الأحيان قد لا يتشكَّل جزء من السبيل الهضمي أو قد يتشكَّل بشكلٍ طبيعي ثم يتخرب بفعل مشكلة تحدث في الرحم قبل الولادة.قد تضعف العضلاتُ الداخلية أو الخارجية المحيطة بتجويف البطن أو تحدث فيها ثقوب، كما هي الحال مع عيوب جدار البطن وفتق الحجاب الحاجز.كما قد لا تتخلق الأعصابُ الخاصَّة بالأمعاء أيضًا، كما هي الحال بالنسبة إلى داء هيرشسبرونغ.
أعراض العيوب الخَلقية في القَناة الهضميَّة
تستنِدُ الأعراضُ إلى نوع العيب الخلقيّ وموضعه،وقد يُعاني الرضع من مغصٍ أو تورُّم في البطن أو تقيُّؤ.يمكن أن تحدثَ مشاكل في التغذية، وقد يفشل الرضّع في اكتساب الوزن بشكلٍ طبيعي،ويحدُث تغيُّر في لون الجلد إلى الأصفر عند بعض الرُّضع يُسمَّى اليرقان jaundice اليَرَقان عند حديث الولادة اليرقان jaundice هو اصفرار لون الجلد أو العينين النَّاجم عن زيادة مستويات البِيِلِيروبينِ في مجرى الدَّم.البِيلِيروبين مادة صفراء تتشكَّل عندما يتفكَّك الهيموغلوبين (جزء من خلايا الدَّم الحمراء... قراءة المزيد 
.
تشخيص العيوب الخَلقية في القَناة الهضميَّة
الفُحوصات التصويرية (الأشعَّة السِّينية والموجات فوق الصوتية)
تكون الفُحوصات التصويرية مطلوبة عادة لتشخيص العيب الخلقيّ في السبيل الهضميّ.في بعض الأحيان يجري الكشف عن العيوب قبل الولادة من خلال تخطيط الصدى قبلَ الولادة التصوير بتخطيط الصدى ينطوي الاختبار التشخيصي قبل الولادي على إجراء اختبار للجنين قبل ولادته لتحديد ما إذا كان يعاني من شذوذات معينة، بما في ذلك بعض الاضطرابات الجينية الموروثة أو التي حدثت بشكل عفوي. يمكن لقياس... قراءة المزيد الذي يُجرى بشكلٍ روتينيّ.تُشخص بعض العيوب بعدَ الولادة باستخدام الأشعة السينية الأشعَّةُ السِّينية البسيطة الأشعَّة السِّينية X-rays هي موجات من الإشعاع عالي الطاقة، يمكن أن تخترق معظمَ المواد (بدرجاتٍ متفاوتة).بجرعات منخفضة جدًّا، تُستخدَم الأشعَّة السِّينية لإنتاج الصور التي تساعد الأطباء على تشخيص... قراءة المزيد للصدر أو البطن.وقد يستخدم الأطباء أيضًا تخطيط الصدى التصويرُ بالموجات فوق الصوتيَّة Ultrasonography يستخدِم التصويرُ بالموجات فوق الصوتية الموجاتِ الصوتية عالية التردد (الموجات فوق الصوتية) لإنتاج صور للأعضاء الداخلية والأنسجة الأخرى.ويقوم جهاز يُسمَّى المحوِّل أو الترجام transducer بتحويل... قراءة المزيد 
بعد الولادة للتعرّف إلى العيوب وتحديد مواضعها.
قد تنطوي الاختبارات الأخرى على اختبارات الدَّم والخزعات؛وفي أثناء الخزعة، يجرِي أخذُ قطعة من النسيج لتفحّصها تحت المجهر.
كما تُجرى اختبارات أخرى، مثل الاختبارات الجينية، استنادًا إلى نتائج الاختبارات والأَعرَاض.
علاج العيوب الخَلقية في القَناة الهضميَّة
الجرَاحة
يحتاجُ معظمُ عيوب السبيل الهضمي إلى الجراحة،ويَجرِي فتح الانسدادات جراحيًا عادةً،كما يجري إغلاق ما حدث من ضعف أو ثقوب في العضلات المُحيطة بالتجويف البطنيّ عن طريقِ الخياطة.
