Здоровый человек живет в гармонии с микробной флорой, которая помогает защитить ее хозяина от вторжения болезнетворных микроорганизмов, обычно определяемых как микроорганизмы, способные вызвать болезнь. Микрофлора – главным образом бактерии и грибы – включает нормальную резидентную флору, которая присутствует в течение всей жизни и быстро восстанавливается в случае нарушения, и транзиторную флору, которая может колонизировать хозяина в течение часов-недель, но не сохраняется надолго. Микроорганизмы, которые относятся к нормальной флоре, могут иногда вызывать заболевание, особенно когда нарушены защитные силы.
Лабораторные анализы могут идентифицировать микроорганизмы прямым методом (например, визуально при микроскопии, путем выращивания культур микроорганизмов) или непрямым методом (например, идентифицируя антитела к возбудителю). Основные виды анализов:
Паразиты человека - это организмы, которые живут на человеке или в нем, получая питательные вещества от него (это их хозяин). Существует 3 типа паразитов:
Арбовирус (антропонозный вирус) - это любой вирус, передаваемый человеку и/или другим позвоночным с помощью определенных видов кровососущих членистоногих, в основном насекомых (мух и комаров) и паукообразных (клещей). Арбовирус - описательный термин, основанный на передаче инфекции переносчиками с определенными характеристиками. Он не входит в классификацию вирусов Международного комитета по таксономии вирусов (т.е. не является ни видом, ни родом, ни семейством), которая основана на природе и структуре вирусного генома.
Бактерии – микроорганизмы, имеющие кольцевую двухспиральную ДНК и (за исключением микоплазм) клеточные стенки. Большинство бактерий живут внеклеточно, но некоторые живут и размножаются преимущественно внутри леток. Облигатные внутриклеточные патогены способны расти, размножаться и вызывать заболевание только в клетках хозяина. Примеры этих патогенов включают представителей из класса Chlamydiae, рода Chlamydophila и риккетсии. Факультативные внутриклеточные патогены способны жить и размножаться как внутри, так и вне клеток хозяина. Примеры этих патогенов включают Salmonella typhi, представителей рода Brucella, Francisella tularensis, Neisseria gonorrhoeae, N. meningitidis, представителей родов Legionella и Listeria, и Mycobacterium tuberculosis.
Три вида Chlamydia вызывают заболевания у человека, включая заболевания, передающиеся половым путем, и респираторные инфекции. Диагностика зависит от вида; культуральное исследование, метод амплификации нуклеиновых кислот (МАНК) или серологические тесты. Лечение проводят с помощью доксициклина для небеременных и азитромицина для беременных.
COVID-19 — это острое респираторное заболевание, причиной которого является новый коронавирус SARS-CoV-2. Инфекция может быть бессимптомной или обуславливать симптомы, варьирующиеся от легких симптомов со стороны верхних дыхательных путей до острой дыхательной недостаточности и смерти. COVID-19 может поражать различные системы органов (например, сердечную, почечную, неврологическую, систему коагуляции). Профилактика заключается в вакцинации и соблюдении мер по профилактике инфекций (например, ношение масок для лица, мытье рук, социальное дистанцирование, изоляция инфицированных лиц). Диагноз ставится на основании тестов на антиген или ПЦР (полимеразной цепной реакции) секрета верхних или нижних дыхательных путей. Лечение включает поддерживающую терапию, противовирусные препараты или кортикостероиды.
Энтеровирусы наряду с риновирусами (см. Простуда) и парэкховирусами человека являются вирусами из рода пикорнавирусов (pico- или маленькие РНК-вирусы). Все энтеровирусы генетически гетерогенны и имеют широкое географическое распространение.
Свободноживущие амебы – простейшие, которые обитают в почве или воде и не нуждаются в хозяевах. Они редко вызывают болезнь, в отличие от паразитической амебы Entamoeba histolytica, которая является частой причиной кишечной инфекции ( амебиаза). Патогенные свободноживущие амебы включают представителей родов Acanthamoeba, Balamuthia, Naegleria и Sappinia.
Грибы - это эукариотические организмы, существующие в виде дрожжей, плесени или обеих форм. Дрожжевые грибы состоят из одиночных клеток, размножающихся почкованием. Плесневые грибы образуют нити, называемые также гифами, которые распространяются путем апикального удлинения. Диморфные грибы растут как плесень в окружающей среде и как дрожжевые клетки или сферулы (мешковидные клетки, являющиеся репродуктивной формой гриба) в естественных условиях.
Грамотрицательные бациллы вызывают большое количество болезней. Некоторые являются комменсалами, которые присутствуют среди нормальной кишечной флоры. Эти комменсальные микроорганизмы с другими микроорганизмами от носителей-животных или из источников окружающей среды могут вызвать заболевание.
Вид Acinetobacter – это грамотрицательные организмы, которые могут вызывать гнойные инфекции в любой системе организма; эти бактерии часто являются оппортунистами у госпитализированных пациентов.
Энтерококки являются грамположительными факультативными аэробными организмами. Enterococcus faecalis и E. faecium вызывают различные инфекции, включая эндокардит, инфекцию мочевых путей, простатит, внутрибрюшную инфекцию, целлюлит и раневую инфекцию с сопутствующей бактериемией.
Сибирская язва вызывается грам-позитивной бациллой сибирской язвы (Bacillus anthracis), который представляет собой инкапсулированный факультативный анаэроб, способный выделять экзотоксины. Сибирская язва, часто смертельное заболевание животных, передается людям, контактирующим с зараженными животными продуктами их жизнедеятельности, предметами внешней среды, обсемененными сибиреязвенными спорами. Инфицирование человека происходит, как правило, через кожу. В нечастых случаях бацилла внедряется через слизистые оболочки дыхательных путей; орофарингеальная, менингеальная и желудочно-кишечная инфекции встречаются редко. При внедрении возбудителя через слизистые оболочки дыхательных путей или желудочно-кишечного тракта может развиться тяжелая генерализованная инфекция, сибиреязвенный сепсис и в результате часто смерть. Эмпирическое лечение фторхинолонами или доксициклином. Возможна вакцинация.
Людей заражают восемь типов герпесвирусов ( All.see table Герпесвирусы, которые заражают людей). После первичного инфицирования все герпесвирусы остаются латентными в пределах определенных клеток-хозяев и впоследствии могут реактивироваться. Клинические синдромы, причиной которых является первичное инфицирование, могут значительно отличаться от тех, причиной которых является реактивация данных вирусов. Герпесвирусы не выживают долго вне хозяина; таким образом, для передачи обычно требуется близкий контакт. У людей с латентной фазой инфекции вирус может реактивироваться, не вызывая симптомов; в таких случаях эти люди могут передавать инфекцию.
Инфекция вирусом иммунодефицита человека (ВИЧ) вызывается одним из 2 похожих ретровирусов (ВИЧ-1 и ВИЧ-2), которые разрушают CD4+ лимфоциты и ослабляют клеточный иммунитет, увеличивая риск оппортунистических инфекций и раковых образований. Начальная инфекция может вызвать неспецифичное фебрильное заболевание. Риск последующих проявлений, – связанных с иммунной недостаточностью, – пропорционален снижению уровня CD4+ лимфоцитов. ВИЧ может непосредственно привести к повреждению мозга, половых желез, почек и сердца, вызывая когнитивные нарушения, гипогонадизм, почечную недостаточность и кардиомиопатию. Проявления варьируют от бессимптомного носительства до синдрома приобретённого иммунодефицита (СПИДа), который определяется наличием СПИД-индикаторного заболевания (серьезные оппортунистические инфекции или рак) или количеством CD4 200/мкл. ВИЧ-инфекция может быть диагностирована с помощью тестов на антитела, нуклеиновые кислоты (ВИЧ РНК) или антиген (p24). Скрининговое обследование должно регулярно проводиться среди всех взрослых и подростков. Лечение направлено на подавление репликации ВИЧ с помощью комбинации ≥ 2-х препаратов, ингибирующих ферменты ВИЧ; лечение может восстановить иммунную функцию у большинства пациентов, если подавление репликации сохраняется.
Простейшие — обобщающий термин для некоторых ядросодержащих одноклеточных организмов (эукариот), у которых отсутствует цитодерма и которые не относятся ни к животным, ни к растениям, ни к грибам. Наиболее важные кишечные протозойные патогены, которые вызывают кишечные инфекции у людей, включают
Туберкулез – хроническая прогрессирующая микобактериальная инфекция, часто с бессимптомным латентным периодом после начальной инфекции. Туберкулез чаще всего поражает легкие. Симптомы включают в себя кашель, повышение температуры, потерю веса и недомогание. Диагноз ставится чаще всего по мазку мокроты и посеву и, если возможно, с помощью метода амплификации нуклеиновых кислот. Лечение проводят антибактериальными лекарственными средствами в течение, по крайней мере, 4 мес.
Ангиостронгилез – болезнь, распространяемая личинками червей рода Angiostrongylus. В зависимости от вида заражения развиваются абдоминальные симптомы (Angiostrongylus costaricensis) или поражение нервной системы с эозинофильным менингитом (A. cantonensis). Диагноз основывается на анамнезе и наличии эозинофилии в цереброспинальной жидкости (ЦСЖ) и/или крови. Противоглистные препараты либо неэффективны, либо вредны.
Mpox (оспа обезьян) вызывается вирусом оспы обезьян, ортопоксвирусом, по своей структуре схожим с вирусом натуральной оспы. У пациентов она проявляется в виде везикулярной или пустулезной сыпи, которая может быть болезненной, часто с лихорадкой, недомоганием и лимфаденопатией. Диагноз ставится на основании полимеразной цепной реакции (ПЦР). Лечение, как правило, носит вспомогательный характер и предполагает возможность использования противовирусных препаратов Профилактика включает вакцинацию.
Вирусные инфекции обычно поражают верхние или нижние дыхательные пути. Хотя инфекции дыхательных путей могут классифицироваться согласно возбудителю (например, грипп), они обычно классифицируются клинически согласно синдрому (например, ринофарингит, бронхиолит, ларинготрахеит [круп], пневмония). Хотя определенные болезнетворные микроорганизмы обычно вызывают характерные клинические проявления (например, риновирус, как правило, вызывает ринит, респираторно-синцитиальный вирус, как правило, вызывает бронхиолит), каждый вирус может вызвать множество вирусных респираторных синдромов.
Риккетсиозные заболевания (риккетсиозы) и риккетсиоподобные болезни (анаплазмоз, эрлихиоз, Ку-лихорадка, цуцугамуши) вызываются группой грамотрицательных облигаторных внутриклеточных коккобацилл. Все они, за исключением Coxiella burnetii, переносятся членистоногими. Симптомы обычно включают внезапную лихорадку с сильной головной болью, недомоганием, выраженной слабостью и в большинстве случаев характерной сыпью. Диагноз клинический, подтверждается иммунофлюоресцентным методом или полимеразной цепной реакцией (ПЦР). Лечение первой линии - терапия доксициклином, тетрациклином.
Инфекция, передающаяся половым путем (ИППП), представляет собой инфекцию, вызываемую патогеном, который передается через кровь, сперму, вагинальные жидкости или другие жидкости организма во время орального, анального или генитального секса с инфицированным партнером. Заболевание, передающееся половым путем (ЗППП), относится к распознаваемому болезненному состоянию, развившемуся из ИППП ( 1). ИППП могут быть вызваны рядом микроорганизмов, которые значительно варьируют по размеру, жизненному циклу, восприимчивости к имеющимся методам лечения, а также заболеваниям и симптомам, которые они вызывают.
Беджель, пинта и невенерический сифилис (тропическая фрамбезия) являются хроническими тропическими невенерическими инфекциями, вызываемыми спирохетами, которые распространяются посредством физического контакта. Признаки беджеля – слизисто-мембранные и кожные поражения, сопровождаемые костными и кожными гуммами. Невенерический сифилис вызывает периостит и кожные поражения. При пинте поражения ограничиваются кожей. Диагноз – клинический и эпидемиологический. Лечение проводится азитромицином.
Сосальщики – плоские черви, которые поражают кровеносные сосуды, желудочно-кишечный тракт, легкие или печень. Как правило, их классифицируют на основании основного места окончательной локализации паразита:
Вирусы – это одни из мельчайших микробов, обычно величиной от 0,02 до 0,3 микрометра, хотя недавно были обнаружены несколько очень крупных вирусов длиной до 1 микрометра (megavirus, pandoravirus). Размножение вирусов находится в полной зависимости от клеток (бактериальных, растительных или животных). Некоторые вирусы имеют внешнюю оболочку, состоящую из белка и липидов, окружающую капсидный комплекс белка с геномной РНК или ДНК, а иногда и ферменты, необходимые для первых этапов репликации вируса.