I batteri possono essere classificati a seconda del loro bisogno e della loro tolleranza per l'ossigeno:
Facoltativi: crescono in condizioni aerobiche o anaerobiche in presenza o assenza di ossigeno
Microaerofili: richiede una bassa concentrazione di ossigeno (generalmente 2-10%) e, per molti, un'elevata concentrazione di diossido di carbonio (p. es., 10%); cresce molto poco nell'anaerobiosi
Anaerobi obbligati: sono incapaci di metabolismo aerobico ma sono variamente tolleranti all'ossigeno
Gli anaerobi obbligati replicano in siti a basso potenziale di ossidoriduzione (p. es., tessuto necrotico, tessuto devascolarizzato). L'ossigeno è tossico per loro. Gli anaerobi obbligati sono stati classificati in base alla loro tolleranza a ossigeno:
Stretta: tollerano solo ≤ 0,5% di ossigeno
Moderata: tollerano dal 2 all'8% di ossigeno
Anaerobi aerotolleranti: tollerano ossigeno atmosferico per un tempo limitato
Gli anaerobi obbligati che comunemente causano infezione possono tollerare l'ossigeno atmosferico per almeno 8 h e spesso fino a 72 h.
Gli anaerobi obbligati sono i principali componenti della microflora normale delle mucose, in particolare della bocca, del basso tratto gastrointestinale e della vagina; questi anaerobi causano malattia quando le normali barriere delle mucose vengono alterate o distrutte.
Anaerobi Gram-negativi e alcune delle infezioni che causano comprendono
Bacteroides (il più diffuso): infezioni intra-addominali
Fusobacterium: ascessi, infezioni di ferite o ulcere, e infezioni polmonari ed endocraniche
Porphyromonas: polmoniti da inalazione e periodontiti
Prevotella: infezioni intra-addominali e dei tessuti molli
Anaerobi Gram-positivi e alcune delle infezioni che causano comprendono
Actinomyces: infezioni della testa, del collo, dell'osso, e infezioni addominali e pelviche e polmoniti da inalazione (actinomicosi Actinomicosi L'actinomicosi è un'infezione cronica localizzata o un'infezione ematogena anaerobica causata da Actinomyces israelii e da altre specie di Actinomyces. La diagnosi prevede la presenza... maggiori informazioni
)Clostridi Panoramica sulle infezioni da clostridi I clostridi sono bacilli Gram-positivi formanti spore, diffusamente presenti nelle polveri, nel suolo e nella vegetazione e come flora saprofitica del tratto gastrointestinale dei mammiferi... maggiori informazioni : infezioni intra-addominali Infezioni da clostridi intra-addominali e pelviche I clostridi, primariamente Clostridium perfringens, sono comuni nelle infezioni miste intra-addominali causate da rottura di un viscere o da malattia infiammatoria pelvica. I sintomi... maggiori informazioni (p. es., enterite necrotizzante clostridiale Enterite necrotizzante da clostridi L'enterite necrotizzante da clostridi è la necrosi del digiuno e dell'ileo causata da Clostridium perfringens. I sintomi possono variare da una lieve diarrea allo shock settico fino,... maggiori informazioni ), infezioni dei tessuti molli Infezioni dei tessuti molli da clostridi Le infezioni da clostridi dei tessuti molli comprendono cellulite, miosite e mionecrosi clostridiale. Generalmente si verificano dopo traumi. I sintomi possono comprendere edema, dolore, gas... maggiori informazioni
, e cancrena gassosa a causa di C. perfringens; avvelenamento del cibo Intossicazione alimentare da Clostridium perfringens L'intossicazione alimentare da Clostridium perfringens è una gastroenterite acuta causata dall'ingestione di cibo contaminato. I sintomi sono diarrea acquosa e crampi addominali. La diagnosi... maggiori informazioni a causa di C. perfringens type A; botulismo Botulismo Il botulismo sta avvelenando quello che è dovuto alla tossina Clostridium botulinum e che colpisce i nervi periferici. Il botulismo può verificarsi senza infezione se la tossina viene... maggiori informazioni e botulismo infantile Botulismo infantile Il botulismo infantile risulta dall'ingestione di spore di Clostridium botulinum, dalla loro colonizzazione del grosso intestino e dalla produzione in vivo delle tossine. I sintomi vanno... maggiori informazioni a causa di C. botulinum; tetano Tetano Il tetano è un avvelenamento acuto con una neurotossina prodotta da Clostridium tetani. I sintomi sono spasmi tonici intermittenti dei muscoli volontari. Lo spasmo dei masseteri è responsabile... maggiori informazioni 
a causa di C. tetani; e colite e diarrea da Clostridioides (precedentemente, Clostridium) difficile Diarrea indotta da Clostridioides (precedentemente Clostridium) difficile Le tossine prodotte da ceppi di Clostridioides difficile nel tratto gastrointestinale provocano la colite pseudomembranosa, tipicamente dopo terapia antibiotica. I sintomi sono diarrea... maggiori informazioni (colite pseudomembranosa)Peptostreptococcus e Finegoldia: infezioni orali, respiratorie, ossee e articolari, dei tessuti molli e intra-addominali
Cutibacterium (precedentemente Propionibacterium): infezioni da corpo estraneo (p. es., in uno shunt del liquido cerebrospinale, protesi articolari, o dispositivi cardiaci)
Le infezioni da anaerobi sono tipicamente suppurative causando formazione di ascessi e di necrosi tissutale e talvolta tromboflebiti settiche, formazione di gas o entrambi. Molti anaerobi producono enzimi distruttivi per i tessuti, e alcune delle più potenti tossine paralitiche conosciute.
Solitamente, più specie di anaerobi sono presenti nei tessuti infetti; anche gli aerobi sono spesso presenti (infezioni anaerobiche miste Infezioni da germi anaerobi misti Gli anaerobi possono infettare ospiti normali e con compromissione della resistenza o danno tissutale. Le infezioni anaerobiche miste possono comprendere entrambe le specie anaerobiche singole... maggiori informazioni ).
Indizi di infezione anaerobica comprendono
Risultati polimicrobici sulla colorazione di Gram o su coltura
I batteri sono visibili sulla colorazione di Gram, ma le colture aerobiche sono sterili
Gas nel pus o nei tessuti infetti
Cattivo odore del pus o dei tessuti infetti
Tessuti necrotici infetti
Sede di infezione nei pressi delle mucose, dove risiede abitualmente la microflora anaerobica
Esami
I campioni per la coltura anaerobica devono essere ottenuti da aspirati o da biopsie di sedi normalmente sterili. La consegna al laboratorio deve essere tempestiva e i dispositivi per il trasporto devono fornire un'atmosfera senza ossigeno con diossido di carbonio, idrogeno e azoto. I tamponi sono trasportati nel modo migliore in un mezzo semisolido, sterilizzato in modo anerobico, come il terreno di trasporto Cary-Blair.
