Đánh giá hệ thần kinh tự động bao gồm việc kiểm tra những vấn đề dưới đây:
Thay đổi nhịp tim đáp ứng nghiệm pháp Valsalva
Bằng chứng của Hội chứng Horner (sụp mi một bên, co đồng tử, giảm tiết mồ hôi mặt)
Cần lưu ý đến các rối loạn về ruột, bàng quang, tình dục và chức năng vùng dưới đồi.
(Xem thêm Giới thiệu về Khám Thần kinh và Tổng quan về Hệ Thần kinh tự động.)