Головку мужского полового члена или отверстие мочеиспускательного канала женщины очищают, как правило, при помощи небольшой салфетки, содержащей антисептическое вещество. У необрезанных мужчин необходимо оттянуть крайнюю плоть, чтобы очистить головку полового члена.

Сначала следует выпустить некоторое количество мочи в унитаз для промывки мочеиспускательного канала.

Затем мочеиспускание возобновляется, и образец набирают в стерильную чашку. Обычно образец собирают до момента окончания мочеиспускания (в середине процесса мочеиспускания).