Có hơn 200 rối loạn liên quan đến mô liên kết. Một số rối loạn được đặc trưng bởi sự hoạt động quá mức của hệ thống miễn dịch với kết quả là quá trình viêm và gây tổn thương các mô (ví dụ, lupus ban đỏ hệ thống [SLE] và bệnh viêm khớp tự phát thiếu niên (trước đây gọi là viêm khớp dạng thấp thiếu niên). Các rối loạn khác bao gồm bất thường sinh hóa hoặc khuyết tật cấu trúc của mô liên kết. Một số trong những rối loạn này do di truyền, và một số không rõ nguyên nhân.
Các rối loạn cụ thể được thảo luận ở đây bao gồm