Thuốc được lựa chọn dựa trên đặc tính của chúng (ví dụ như hiệu quả, hồ sơ an toàn, đường dùng, đường thải trừ, tần số sử dụng, giá cả) và bệnh nhân (ví dụ như tuổi, giới tính, các vấn đề y tế khác, khả năng mang thai, dân tộc và các yếu tố di truyền khác). Các loại thuốc khác mà bệnh nhân đang dùng cũng có thể ảnh hưởng đến việc lựa chọn thuốc của bác sĩ. Nguy cơ và lợi ích của thuốc cũng được đánh giá; mỗi một loại thuốc gây ra một số rủi ro.
Đáp ứng với thuốc phụ thuộc một phần vào đặc điểm và thói quen của bệnh nhân (ví dụ như ăn uống hoặc sử dụng chất bổ sung, tuân thủ chế độ điêu trị, sự khác biệt về chuyển hóa do tuổi tác [Xem: Dược động học ở người lớn tuổi], giới tính, chủng tộc, đa hình gen, hoặc suy gan hoặc suy thận), các bệnh mắc kèm và sử dụng các thuốc khác.
Sai sót về thuốc (ví dụ như chỉ định một loại thuốc không phù hợp, đọc nhầm đơn thuốc, sử dụng nhầm thuốc) cũng có thể ảnh hưởng đến đáp ứng.