Le oocisti Cyclospora non sono sporulate (ossia, infettive) quando vengono eliminate nelle feci. Pertanto, la trasmissione oro-fecale diretta non si verifica.

1. Le oocisti non sporulate vengono escrete nelle feci dell'ospite infetto.

2–3. Le oocisti sporulano nell'ambiente dopo 1 o 2 settimane a temperature tra 22 e 32° C.

4. Le oocisti sporulate contaminano cibo o acqua. Il meccanismo della contaminazione non è stato stabilito.

5. Le oocisti sporulate vengono ingerite in cibo o acqua contaminati.

6. Le oocisti vengono liberate nel tratto gastrointestinale, rilasciando gli sporozoiti, che invadono le cellule epiteliali dell'intestino tenue.

7. All'interno delle cellule, si moltiplicano in modo asessuale mentre si sviluppano sessualmente per maturare in oocisti che vengono eliminati nelle feci.