体の状態や病気の中には、腸の内容物が腸内を進む動きを遅らせたり、止めてしまうものがあります。
症状が出ない人もいますが、腹部不快感、下痢、腹部膨満、過剰な鼓腸がみられる人もいます。
診断は症状、とりわけ特定の手術を受けた人や特定の病気がある人に現れた症状に基づいて下されます。
過剰な細菌は抗菌薬で減らすことができます。
小腸内の細菌を適切なバランスに保つためには、小腸の内容物が正常に着実に動く（ぜん動）ことが重要です。腸の内容物の動きが遅くなったり、1カ所にたまる状態が生じると、細菌が過剰に増殖します。このような状態になる例として、胃や腸、またはその両方に対する特定の手術などがあります。糖尿病、全身性硬化症、アミロイドーシスなどの病気でも、ぜん動が緩慢になり、細菌の過剰増殖を引き起こすことがあります。
増えすぎた細菌が炭水化物やビタミンB12などの栄養素を消費するため、摂取カロリーの減少やビタミンB12欠乏症が生じます。また細菌は、消化を助けるために肝臓が分泌する胆汁酸塩も分解します。胆汁酸塩が失われると、脂肪が吸収しにくくなり、下痢や栄養不良が生じます。
症状
特に頻度の高い症状は、腹部不快感、 下痢 成人の下痢 下痢は、便の量や水分、排便回数が増加することです。（小児の下痢も参照のこと。） 排便回数が多いだけでは、下痢を決定づける特徴とはいえません。正常な状態で1日に3～5回排便する人もいます。野菜に含まれる食物繊維をたくさん食べる人は、1日に約500グラム以上の便を排泄することがありますが、この場合の便はよく固まっていて、水様便ではありません。下痢になると腸内ガス、腹部けいれん、便意の切迫を伴うことが多く、下痢が感染性微生物や有害物質によって... さらに読む 、腹部膨満、過剰な鼓腸です。症状がほとんどない人や、体重減少や栄養欠乏しかみられない人もいます。他に重度の下痢や脂肪便（明るい色で、柔らかく、量の多い、脂ぎった便で、異常な悪臭を放つ）がみられる人もいます。
診断
医師による症状の評価
呼気試験と便培養
X線検査
診断は典型的な症状、とりわけ特定の手術を受けた人や特定の病気がある人に現れた症状に基づいて下されます。
ときに 内視鏡検査 内視鏡検査 内視鏡検査とは、柔軟な管状の機器（内視鏡）を用いて体内の構造物を観察する検査です。チューブを介して器具を通すことができるため、内視鏡は多くの病気の治療にも使うことができます。口から挿入する内視鏡検査では、食道（食道鏡検査）、胃（胃鏡検査）、小腸の一部（上部消化管内視鏡検査）が観察できます。肛門から挿入する内視鏡検査では、直腸（肛門鏡検査）、大腸下部と直腸と肛門（S状結腸内視鏡検査）、大腸全体と直腸と肛門（大腸内視鏡検査）が観察できます。... さらに読む （柔軟性のある管状の機器を小腸まで挿入する検査）の際に体液のサンプルを採取することもあります。この体液を培養して、存在する細菌の量を調べます。
この代わりに、14C-キシロース呼気試験などの呼気試験が多く行われます。この検査では、糖（キシロース）に結合させたかすかに放射性のある特殊なマーカー（炭素14）を含む液体を飲みます。過剰に増えた細菌によってキシロースが分解されると、炭素14が呼気中に検出できます。
ときには腸内細菌が異常増殖しやすくなる内部構造の異常がみられることがあります。このような異常を検出するために、X線写真に写る液体を飲んだ後に胃や小腸のX線検査（上部消化管造影検査と呼ばれる）が行われます。
治療
抗菌薬
食事の変更
大半の人では、抗菌薬を10～14日内服すると改善します。
炭水化物により腸内細菌の異常増殖が速くなるため、脂肪が豊富で、炭水化物と食物繊維をあまり含まない食事に変更する必要があります。栄養素の欠乏がある場合はそれを治すサプリメントが処方されます。
