एंटीबॉडीज़ मॉलिक्यूल का आकार, मूल रूप से Y की तरह होता है। मॉलिक्यूल के दो हिस्से होते हैं:

परिवर्तनशील हिस्सा: यह हिस्सा अलग-अलग एंटीबॉडीज़ में अलग-अलग होता है, यह इस बात पर निर्भर है कि एंटीबॉडी का लक्ष्य कौन-सा एंटीजेन है। एंटीजेन, परिवर्तनशील हिस्से से जुड़ता है।

स्थिर हिस्सा: यह हिस्सा, पाँच संरचनाओं में से एक हो सकता है, जिससे एंटीबॉडीज़ का वर्ग—IgM, IgG, IgA, IgE, या IgD तय होता है। यह हिस्सा, प्रत्येक वर्ग के अंदर समान होता है।