Les infections mycosiques sont souvent classées comme
Opportunistes
Primitives
Les infections opportunistes sont celles qui se développent principalement chez les sujets immunodéprimés.
Des infections primitives peuvent se développer chez des hôtes immunocompétents.
Les infections fongiques peuvent être
Local
Systémiques
Les infections mycosiques locales concernent habituellement la peau (voir Infections mycosiques cutanées Revue générale de dermatophytoses Les dermatophytoses sont des infections mycosiques des kératines de la peau et des ongles (l'infection des ongles est appelée teigne unguéale, ou onychomycose). La symptomatologie varie selon... en apprendre davantage ), ou la cavité orale (causant une stomatite Stomatite Une inflammation buccale et des ulcères, appelés stomatite, peuvent être légers et localisés ou sévères et disséminés. Ils sont invariablement douloureux. (Voir aussi Évaluation de l'état bucco-dentaire... en apprendre davantage 
) et/ou le vagin (causant une vaginite à Candida Vaginite candidosique La vaginite candidosique est une infection vaginale à Candida spp, habituellement C. albicans. (Voir aussi Revue générale des vaginites.) La plupart des vaginites fongiques est... en apprendre davantage 
) et peuvent survenir chez des patients immunocompétents ou immunodéprimés.
Les infections fongiques systémiques peuvent affecter la peau et les organes tels que les poumons, les yeux, le foie et le cerveau et se produisent généralement chez les hôtes immunodéprimés (voir Infections opportunistes fongiques Infections mycosiques opportunistes Les infections mycosiques sont souvent classées comme Opportunistes Primitives Les infections opportunistes sont celles qui se développent principalement chez les sujets immunodéprimés. Des... en apprendre davantage ).
(Voir aussi Antimycosiques Antimycosiques Les médicaments antifongiques systémiques comprennent les suivants ( Médicaments des infections mycosiques systémiques): Amphotéricine B (et ses formulations lipidiques) Divers dérivés azolés... en apprendre davantage .)
Infections mycosiques opportunistes
Beaucoup de champignons microscopiques sont opportunistes et ne sont habituellement pas pathogènes sauf chez le patient immunodéprimé. Les causes de déficit immunitaire comprennent le SIDA, l'azotémie, le diabète sucré, le lymphome, la leucémie, d'autres hémopathies malignes, les brûlures et les traitements corticostéroïdiens, les immunosuppresseurs ou les antimétabolites. Les patients qui passent plusieurs jours en unité de soins intensifs peuvent avoir un déficit immunitaire du fait de procédures médicales, de troubles sous-jacents et/ou de dénutrition.
Les infections opportunistes mycosiques systémiques typiques (mycoses) comprennent les suivantes
Fusariose
Les mycoses systémiques qui touchent le patient très immunodéprimé se présentent souvent de manière aiguë, avec une pneumonie rapidement évolutive, une fongémie, des signes de dissémination extra-pulmonaire.
Infections mycosiques primitives
Les infections mycosiques primitives résultent habituellement d'une inhalation de spores mycosiques, ce qui peut entraîner une pneumonie localisée comme une manifestation primitive de l'infection.
Chez les patients immunocompétents, les mycoses systémiques ont habituellement une évolution chronique; les mycoses disséminées avec pneumopathie et septicémie sont rares et, en cas de lésions pulmonaires, progressent habituellement lentement. Des mois ou des années peuvent s'écouler avant qu'un avis médical ne soit demandé ou qu'un diagnostic ne soit posé. Les symptômes sont rarement intenses dans ces mycoses chroniques, mais une fièvre, les frissons, des sueurs nocturnes, une anorexie, une perte de poids, un malaise et une dépression peuvent se produire. Divers organes peuvent être infectés, entraînant des symptômes et un dysfonctionnement.
Les infections mycosiques primitives peuvent avoir une répartition géographique spécifique, ce qui est particulièrement vrai pour les mycoses endémiques dues à certains champignons dimorphiques. Par exemple
Coccidioïdomycose Coccidioïdomycose La coccidioïdomycose est une maladie pulmonaire ou par diffusion hématogène due au champignon Coccidioides immitis; et C. posadasii qui se manifeste habituellement comme une infection... en apprendre davantage
: confinée principalement au Sud-Est des USA, Washington, Nord du Mexique et Amériques centrale et du SudHistoplasmose Histoplasmose L'histoplasmose est une maladie pulmonaire hématogène due à Histoplasma capsulatum; elle est souvent chronique et apparaît habituellement après une infection primitive asymptomatique... en apprendre davantage
: observée essentiellement dans l'Est et le Centre Ouest des États-Unis (Midwest) et des parties d'Amérique centrale et du Sud, d'Afrique, d'Asie et d'AustralieParacoccidioïdomycose Paracoccidioïdomycose La paracoccidioïdomycose est une mycose évolutive des poumons, de la peau, des muqueuses, des ganglions et des organes, due à Paracoccidioides brasiliensis. Les symptômes sont des ulcérations... en apprendre davantage
(précédemment nommée blastomycose Sud-américaine): n'est observée que sur ce continent
Des voyageurs peuvent cependant présenter une telle maladie à n'importe quel moment après un séjour dans ces régions d'endémies.
Lorsque des champignons se propagent à partir d'un site primaire dans les poumons, les manifestations peuvent être les caractéristiques suivantes:
Histoplasmose disséminée évolutive: une atteinte généralisée du système réticulo-endothélial (foie, rate, moelle osseuse)
Blastomycose: lésions cutanées uniques ou multiples ou atteinte de la prostate
Coccidioïdomycose: infections ostéoarticulaires, lésions de la peau, et méningite
Diagnostic des infections mycosiques
Cultures et colorations
Histopathologie
Tests sérologiques (principalement pour Aspergillus, Blastomyces, Candida, Coccidioides, Cryptococcus, et Histoplasma)
Diagnostic moléculaire
Si les médecins suspectent une infection mycosique primitive aiguë ou chronique, ils doivent obtenir un antécédent détaillé de voyages et de logement afin de déterminer si les patients ont pu être exposés à certaines mycoses endémiques, éventuellement des années auparavant.
L'infection pulmonaire fongique doit être différenciée des tumeurs et des pneumonies chroniques dues à des microrganismes non mycosiques tels que les mycobactéries Infections mycobactériennes non tuberculeuses Il existe plus de 170 espèces reconnues de mycobactéries, principalement environnementales. L'exposition environnementale à un grand nombre de ces microrganismes est fréquente, mais la plupart... en apprendre davantage (dont Mycobacterium tuberculosis). Des prélèvements sont mis en culture pour la recherche de champignons et des mycobactéries et en anatomopathologie. L'expectoration peut être utile, mais le lavage bronchoalvéolaire, plus rarement une biopsie transthoracique ou même une intervention chirurgicale, peut parfois être nécessaire pour obtenir un prélèvement efficace.
Les champignons responsables d'infections systémiques primitives sont facilement reconnus par leur aspect histopathologique. L'identification du champignon spécifique peut cependant être difficile et nécessite habituellement une culture sur milieu fongique ou le diagnostic moléculaire. L'interprétation clinique d'une culture positive de l'expectoration n'est pas simple si elle ne met en évidence que des microrganismes commensaux (p. ex., Candida albicans) ou des champignons ubiquitaires de l'environnement (p. ex., Aspergillus spp). Par conséquent, d'autres éléments (p. ex., facteurs de l'hôte tels qu'une immunosuppression, des éléments sérologiques, une invasion tissulaire observée à la biopsie, des signes radiologiques) peuvent être nécessaires pour établir un diagnostic.
Les tests sérologiques permettent de mettre en évidence de nombreuses mycoses systémiques si la culture et l'histopathologie sont indisponibles ou non probantes, bien qu'elles ne fournissent pas des diagnostics définitifs. En particulier, les examens suivants sont utiles:
Mesure des Ag spécifiques du microrganisme, notamment à partir de Cryptococcus neoformans, Histoplasma capsulatum, et Aspergillus spp (une réactivité croisée occasionnelle avec d'autres champignons a été observée avec chacun de ces tests sérologiques)
Le bêta-glucane sérique, souvent positif dans la candidose et l'aspergillose invasives ainsi que dans les infections à Pneumocystis jirovecii
Réaction de fixation du complément et test immunoenzymatique plus récent pour détecter les anticorps anticoccidiens, qui sont assez spécifique et ne nécessitent pas une preuve d'augmentation des niveaux (des titres élevés confirment le diagnostic et indiquent un risque élevé de dissémination extra-pulmonaire)
La plupart des autres examens permettant de déceler des anticorps contre les champignons ont une sensibilité et/ou une spécificité faibles et nécessitent de mesurer les titres en phase aiguë et en phase de convalescence, ils ne peuvent donc être utilisés pour débuter un traitement.
Les diagnostics moléculaires sont des outils émergents utiles pour identifier les composants moléculaires de certaines infections fongiques. Les tests approuvés par la FDA (U.S. Food and Drug Administration) comprennent des sondes ADN qui utilisent des prélèvements de culture pour identifier Histoplasma, Blastomyces, et Coccidioides et une Polymerase Chain Reaction (PCR) ou des tests d'hybridation de l'ADN qui utilisent des prélèvements d'hémocultures pour identifier Candida. La Matrix-assisted laser desorption ionization–time of flight (MALDI-TOF Spectroscopie de masse Lorsqu'un microrganisme a été isolé par culture, il doit être identifié. L'identification est importante pour déterminer la prise en charge (p. ex., traitement médicamenteux, mesures d'isolement)... en apprendre davantage ) mass spectrometry, est une spectrométrie de masse effectuée sur des prélèvements de culture qui peut également être effectuée pour identifier de multiples levures, dont Candida spp.
