Les champignons sont des organismes vivants, mais ce ne sont pas des plantes ou des animaux. Tous les êtres vivants sont divisés en catégories appelées règnes, et les champignons ont leur propre règne.
Certains champignons provoquent des infections chez l’homme :
Certains champignons provoquent des infections cutanées (voir aussi Infections mycosiques de la peau).
Les champignons peuvent se développer sous deux formes :
Levures : cellules rondes individuelles
Moisissures : plusieurs cellules formant de longs filaments étroits appelés hyphes
Certains existent sous ces deux formes au cours de leur cycle de vie. Ces champignons sont appelés champignons dimorphiques.
Les champignons poussent souvent dans le sol et dans les matériaux d’origine végétale en décomposition. De nombreux champignons, y compris la moisissure du pain, et les « vrais champignons », sont visibles à l’œil nu.
Le saviez-vous ?
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Les champignons se reproduisent par diffusion de spores microscopiques. Ces spores sont souvent présentes dans l’air et le sol, et peuvent être inhalées ou se déposer à la surface de tout l’organisme, principalement la peau. Les infections fongiques (mycoses) atteignent donc généralement les poumons ou la peau.
La majorité des spores présentes sur la peau ou inhalées dans les poumons ne provoquent pas d’infection. Quelques types provoquent une infection uniquement chez les personnes présentant ce qui suit :
Système immunitaire affaibli
Corps étrangers dans leur corps, y compris les dispositifs médicaux (par exemple une articulation ou une valve cardiaque artificielle)
Le système immunitaire peut être affaibli lorsque les personnes prennent des traitements qui dépriment ce système (immunosuppresseurs), comme les chimiothérapies ou les médicaments utilisés dans la prévention du rejet des greffes d’organes, ou suite à des pathologies qui entraînent une immunodéficience, telles que le SIDA. Les personnes qui passent plusieurs jours dans une unité de soins intensifs peuvent développer un système immunitaire affaibli en raison d’interventions médicales, de troubles sous-jacents, de dénutrition ou d’une combinaison de ces facteurs.
En dehors de certaines infections des couches superficielles de la peau, les mycoses se transmettent rarement d’une personne à l’autre.
Elles peuvent affecter une seule région du corps (localisées) ou plusieurs régions du corps (systémiques).
Les infections fongiques localisées n’affectent qu’une seule région du corps. Elles affectent généralement la peau et les ongles, le vagin ou la bouche et peuvent survenir chez les personnes ayant un système immunitaire normal ou affaibli.
Les infections mycosiques localisées surviennent parfois lorsque le mélange d’autres micro-organismes (par exemple, des bactéries) qui vivent normalement dans certaines parties de l’organisme (également appelé microbiome) est déséquilibré. Par exemple, certains types de champignons (tels que les Candida) sont normalement présents à la surface du corps ou dans l’intestin. Les bactéries normales de la flore intestinale et vaginale limitent le développement de ces champignons dans ces régions. Les antibiotiques prescrits dans le cadre d’un traitement peuvent éliminer ces bactéries protectrices et permettre aux champignons de se développer de façon anarchique. Il en résulte une croissance massive des champignons qui peut se manifester par des symptômes, généralement bénins. Lorsque les bactéries se multiplient de nouveau, l’équilibre se rétablit et le trouble disparaît.
Les infections fongiques systémiques peuvent toucher les organes tels que poumons, yeux, foie et cerveau, et peuvent également affecter la peau. Elles surviennent généralement chez des personnes dont le système immunitaire est affaibli.
Les infections fongiques sont :
Infections fongiques opportunistes
Les infections fongiques opportunistes profitent de la faiblesse du système immunitaire. Elles surviennent donc généralement chez les personnes dont le système immunitaire est affaibli par des troubles tels que le SIDA ou par des médicaments qui inhibent le système immunitaire. Les infections fongiques opportunistes sont présentes partout dans le monde.
Exemples d’infections fongiques opportunistes :
Les infections fongiques opportunistes peuvent être très agressives, se propager rapidement à d’autres organes et sont souvent mortelles.
Primo-infections fongiques
Les infections fongiques primitives peuvent survenir chez des personnes dont le système immunitaire est normal, parfois avec des conséquences graves. Ces infections surviennent généralement après inhalation de spores fongiques, qui peuvent provoquer une pneumonie comme premier signe d’infection.
Certaines infections fongiques primitives sont plus fréquentes dans certaines zones géographiques, comme dans les exemples suivants :
L’histoplasmose est particulièrement fréquente aux États-Unis dans les vallées de l’Ohio et du Mississippi, dans le centre de l’état de New York et au Texas. Elle est également présente dans certaines parties de l’Amérique centrale et du Sud, en Afrique, en Asie et en Australie.
La blastomycose, quant à elle, est observée essentiellement dans le centre et l’est des États-Unis. Elle survient également en Afrique et dans la vallée du Saint-Laurent au Canada.
La coccidioïdomycose survient presque exclusivement dans le sud-ouest des États-Unis, dans l’État de Washington, ainsi que dans le nord du Mexique, en Amérique centrale et du Sud.
La paracoccidioïdomycose est observée principalement en Amérique du Sud.
Comme le délai entre la transmission et le développement d’une infection varie, les voyageurs peuvent développer des symptômes après leur retour de ces régions.
De nombreuses infections fongiques primitives se développent lentement, et des mois ou années peuvent s’écouler avant que la personne ne consulte un médecin. Si le système immunitaire est normal, les mycoses ne se propagent pas aux organes profonds de l’organisme.
Diagnostic des infections fongiques
Mise en culture et examen d’un échantillon
Analyses de sang
Si les médecins suspectent une infection fongique primitive, ils posent des questions aux personnes afin d’établir le diagnostic. Par exemple :
Où elles se sont rendues et où elles vivent, afin de déterminer si elles ont pu être exposées à certains champignons, même si cette exposition a eu lieu plusieurs années auparavant
Si elles prennent des médicaments qui peuvent inhiber le système immunitaire
Si elles présentent une affection affaiblissant le système immunitaire
Les médecins prélèvent alors un échantillon qui sera mis en culture dans un laboratoire et examiné au microscope. L’échantillon peut être des expectorations ou du sang, mais parfois, les médecins doivent prélever un échantillon dans les poumons. Pour prélever un échantillon de poumon, les médecins insèrent une sonde d’observation souple (bronchoscope) dans la bouche jusque dans les voies respiratoires. Du liquide est projeté au travers de la sonde, puis est réaspiré, rapportant avec lui des cellules et des champignons (ou d’autres micro-organismes), le cas échéant. Parfois, une biopsie ou une intervention chirurgicale sont nécessaires pour prélever un échantillon.
Si le diagnostic n’est pas évident, des analyses de sang peuvent être réalisées. Ces analyses recherchent les éventuels anticorps (qui sont produits par le système immunitaire de la personne en réponse à des substances étrangères, y compris des champignons), antigènes (molécules provenant des substances étrangères qui peuvent déclencher une réponse immunitaire de l’organisme), ou autres preuves d’une présence de champignons.
Des tests de détection du matériel génétique des micro-organismes sont également réalisés pour certaines infections fongiques.
Traitement des infections fongiques
Médicaments antifongiques
Plusieurs médicaments sont actifs contre les infections fongiques, mais la structure et la composition chimique des champignons rend leur élimination difficile.
En cas de mycose, les antifongiques peuvent être appliqués directement sur la peau ou d’autres surfaces corporelles, comme le vagin ou l’intérieur de la bouche. Les médicaments antifongiques peuvent également être administrés par voie orale ou injectable pour traiter les infections plus graves.
Dans le cas des infections graves, il est souvent nécessaire de faire un traitement pendant plusieurs mois.
