奈瑟菌科共分5个属，包括了几乎所有的致病性革兰阴性需氧球菌，分别是：
最重要的人类致病菌都属于其中的Neisseria奈瑟菌属。
大多数食腐性的奈瑟菌科菌寄居在人体的口咽、阴道或直肠部位，但是很少致病。
Moraxella catarrhalis卡他莫拉菌（Moraxella catarrhalisoraxella catarrhalis）感染可导致儿童中耳炎，儿童及成人鼻窦炎以及加重慢性阻塞性肺病，部分情况下可导致成人社区获得性肺炎和不太常见的菌血症。超过六种的 Moraxella莫拉菌属和相关的 Kingella kingae金氏杆菌还可以导致中枢系统、呼吸系统、泌尿生殖系统、心内膜、骨骼以及关节的感染。
人类是Neisseria奈瑟菌唯一的储存场所，人与人之间的传播是主要的传播途径。脑膜炎奈瑟菌 N. meningitidis（脑膜炎球菌）和淋病奈瑟球菌N. gonorrhoeae（导致 淋病）感染可表现为无症状携带状态。对于脑膜炎球菌来说，由于病原携带者状态与疾病流行密切相关，因此非常重要。
