细菌是具有环状双链DNA和（除支原体以外）细胞壁的微生物。大多数细菌生活在细胞外，但有些细菌优先在细胞内生存和复制。专性细胞内病原体只能在宿主细胞内生长、繁殖和引起疾病。这些病原体的例子包括衣原体、嗜衣原体种和立克次体。兼性细胞内病原体能够在宿主细胞内外生存和繁殖。这些病原体的例子包括 伤寒沙门氏菌 沙门菌 Salmonella感染概述 Salmonella属 分为2种, S. enterica 和 S. bongori, 共包括> 2500种已知的血清型。其中一些血清型已被命名。这种情况下，通常使用的命名有时简化了科学命名，只包含种属和血清型... Common.TooltipReadMore 、 布鲁氏菌 布鲁菌病 布鲁菌病是一种由 Brucella 属革兰阴性菌引起的感染。症状首先表现为急性发热，极少或没有局部体征。疾病可进展至慢性期，出现反复发热、乏力、出汗和全身酸痛及疼痛。诊断通过病原菌培养，一般为血培养。最佳治疗通常需要联合使用两种抗生素：多西环素或复方新诺明加庆大霉素、链霉素或利福平。... Common.TooltipReadMore 种、 土拉弗朗西斯菌 土拉菌病 土拉菌病是由革兰阴性弗朗西斯土拉菌 Francisella tularensis引起的发热性疾病，与 伤寒相似。其特征表现为原发性局部溃疡病损，局部淋巴结病，深部全身性症状，偶尔表现为不典型肺炎。主要根据流行病学和临床表现诊断。治疗使用链霉素、庆大霉素、氯霉素、环丙沙星，或强力霉素。... Common.TooltipReadMore 
、 淋球菌 淋病 淋病由奈瑟淋球菌Neisseria gonorrhoeae感染引起。其一般感染尿道、宫颈、直肠、咽或结膜，导致刺激症状和化脓性改变。较少播散至皮肤和关节。显微镜镜检、培养或核酸扩增检测可用于诊断。数种口服及注射用抗生素可用于治疗，但不断增长的耐药是一个问题。... Common.TooltipReadMore 
、 脑膜炎奈瑟菌 脑膜炎奈瑟菌 脑膜炎球菌（脑膜炎奈瑟球菌）是引起脑膜炎和脑膜炎球菌血症的革兰氏阴性双球菌。临床症状往往比较严重，包括头痛、呕吐、畏光、嗜睡、皮疹、多脏器衰竭、休克以及弥散性血管内凝血（DIC）等。可临床诊断，但确诊需依靠细菌培养。治疗主要是青霉素或第3代头孢菌素。... Common.TooltipReadMore 
、 军团菌 Legionella军团菌感染 Legionella pneumophila 是一种革兰氏阴性杆菌，最常引起具有肺外特征的肺炎。 诊断需要特定的生长培养基、血清或尿抗原检测或聚合酶链反应分析。 治疗使用大环内酯类、氟喹诺酮类药物或多西环素。 Legionella... Common.TooltipReadMore 
、 李斯特菌 李斯特菌病 利斯特菌病是由利斯特菌Listeria所致的菌血症、脑膜炎、脑炎、皮炎、眼腺综合征、宫内和新生儿感染或罕见的心内膜炎。症状根据感染器官的不同而不同。宫内感染可导致胎儿死亡。通过分离出细菌而确诊。治疗包括青霉素、氨苄青霉素（常合并使用氨基糖苷类）或甲氧苄啶/磺胺甲恶唑。... Common.TooltipReadMore 种和 结核分枝杆菌 （TB） 结核 结核病是一种慢性进行性分枝杆菌感染，通常在最初感染后有无症状潜伏期。肺结核最常见于肺部。表现为咳嗽、咳痰、发热、消瘦及乏力。最常见的诊断方法是痰涂片和培养，如果可以，还可以通过核酸扩增检测。抗结核治疗需联合用药至少4个月。 （参见 围产期结核病... Common.TooltipReadMore 
。
许多细菌作为正常菌群存在于人体内，通常数量大，且在体内许多部位存在（如在胃肠道和皮肤）。其中仅小部分是人类的致病菌。
形态学
染色
包膜
需氧性
形态学
细菌可能是
圆柱形（杆菌）
球状（球菌）
螺旋（螺旋体）
少数球菌、部分杆菌以及大部分螺旋体是能动的。
染色
鉴别普通细菌最常用的染色法为革兰染色。革兰阳性菌在经过碘固定、乙醇脱色和番红复染后能保留紫色的染料结晶（表现为深蓝色），革兰阴性菌则不能保留紫色结晶，呈现红色。革兰阴性菌多一层含脂多糖（内毒素）的外膜，这使得这类细菌的毒力增加。（其他增强细菌的致病性的因素见 促进微生物入侵的因素 有利于微生物侵袭的因素 以下情况有利于微生物入侵： 毒力因子 微生物黏附 对抗生素的抵抗 宿主具免疫缺陷 Common.TooltipReadMore ）。
抗酸染色和金永染色是耐酸染色，主要用于鉴定分枝杆菌，尤其是M. tuberculosis结核分枝杆菌。他们还可以识别革兰氏阳性杆菌 诺卡氏菌 奴卡放线菌病 奴卡放线菌病是一种急性或慢性，常为弥散化脓性或肉芽肿性感染，通常由多种来自革兰阳性杆状奴卡放线菌属Nocardia的需氧土壤腐生菌引起。典型表现为肺炎，但也常见皮肤和中枢神经系统感染。通过培养和特殊染色诊断。治疗通常使用磺胺类药物。... Common.TooltipReadMore 
和原生动物 隐孢子虫 隐孢子虫病 隐孢子虫病为Cryptosporidium隐孢子虫属原虫感染所致。主要的症状为水样泻，并常常伴有其他消化道症状。该病在免疫力正常的患者中为自限性，但在那些AIDS患者中则可导致持续性和严重的疾病。诊断主要通过在粪便中检测到微生物或抗原。免疫健全患者的治疗，有需要时，可用硝唑尼特。... Common.TooltipReadMore 
, 环孢菌 环孢子虫病 环孢子虫病是由于原虫Cyclospora cayetanensis卡耶塔环孢子虫感染所致。症状包括水样腹泻并伴随有消化道和全身症状。诊断主要通过在粪便或肠活检标本中找到特征性的包囊。治疗药物为甲氧苄氨嘧啶/磺胺甲基异噁唑。 （参见... Common.TooltipReadMore 
， 和 胞质异孢菌 等孢球虫病 等孢子囊病是是原虫感染贝氏囊等孢虫（以前称为贝氏等孢子球虫）。症状包括水样腹泻并伴随有消化道和全身症状。诊断主要通过在粪便或肠活检标本中找到特征性的包囊。治疗药物为甲氧苄氨嘧啶/磺胺甲基异噁唑。 （参见 肠道原虫和微孢子虫感染概述。）... Common.TooltipReadMore 
。 石炭酸复红试剂初染，之后用盐酸和乙醇进行脱色，并且用亚甲基蓝进行复染色。
荧光染料的染色法（例如，金胺 - 罗丹明）也可鉴定抗酸染色的生物体，但此染色法需要特殊的荧光显微镜。
包膜
一些细菌由荚膜包围，对于一些有荚膜的细菌（如， Streptococcus pneumoniae 链球菌感染 链球菌是革兰阳性需氧菌，可引起多种疾病，包括喉炎、肺炎、创面和皮肤感染、败血症和感染性心内膜炎。症状随感染部位而异。 A组溶血性链球菌感染的后遗症包括风湿热和肾小球肾炎。多数菌株对青霉素敏感，但近期出现大环内酯类药物耐药。 (参见 肺炎球菌感染、... Common.TooltipReadMore 
, Haemophilus influenzae Haemophilus嗜血杆菌感染 革兰阴性嗜血杆菌 Haemophilus 可引起多种轻度和重度的感染，包括：菌血症、脑膜炎、肺炎、鼻窦炎、中耳炎、蜂窝织炎和会厌炎。通过细菌培养和血清学分型可以诊断。治疗使用抗生素。 许多嗜血杆菌 Haemophilus是上呼吸道的正常菌群，很少引起疾病。... Common.TooltipReadMore ），夹膜的存在可阻止吞噬细胞对细菌的吞噬。包膜增加了细菌的毒力。
需氧性
需氧菌 （专性需氧）在培养基中生长和产能需要氧气。它们利用细胞有氧呼吸作用产生能量。
厌氧菌（专性厌氧 厌氧菌 厌氧菌根据不同的O2依赖和耐受程度可以分为： 兼性厌氧菌：有O2及无O2均可生长； 微需氧：需低氧浓度（通常为2% - 10%），对于多数细菌而言需要高二氧化碳浓度（如10％）；在无氧环境中生长缓慢。 专性厌氧菌：无法进行有氧代谢，但对O2耐受程度不一。... Common.TooltipReadMore ）则不需要氧气，在有空气存在的培养基中无法生长。它们通过发酵或者无氧呼吸来产生能量。厌氧菌通常位于胃肠道内、阴道内、牙缝中以及血供受损的慢性伤口内。
兼性菌可以在有氧或无氧的环境中生长。它们在缺乏氧气时通过发酵或无氧呼吸产生能量，而在有氧的情况下通过有氧细胞呼吸作用产生能量。 微量需氧菌更适合在减少氧浓度的环境下（如2%～10%）生存。
衣原体是专性胞内寄生菌，从宿主细胞中获得能量，自身并不产生能量。
