人体内通常含有数百种不同种类的细菌，但细菌个数达数万亿个。

这些细菌大多存在于以下地方：

不同种属存在于不同部位，也提示每一部位不同的生理状况。

大多数细菌属于厌氧菌—即生存过程不需要氧。

这些厌氧菌一般情况下不会致病。许多厌氧菌对人体有益，如帮助分解肠道内的食物。

但是，如果粘膜受损，厌氧细菌会引起疾病。细菌可以进入其生存范围之外且对其无抵御能力的组织。细菌可以感染临近器官（如鼻窦、中耳、肺、脑、腹腔、骨盆及皮肤）或侵入血液系统四处播散。