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医生可通过探查术获得肝组织样本，但更常用的方法是用一根中空的针经皮穿刺进入肝获得样本。这种活检称为经皮肝穿刺活检，还有一种是经静脉肝活检。
肝活检可以发现别的检查不能观察到的一些病变。医生常将肝活检应用于诊断肝内脂肪过多（脂肪肝）、慢性肝脏炎症（慢性肝炎）、肝代谢性疾病（如肝豆状核变性[铜过量沉积]和血色病[铁超负荷]）、肝移植后并发症和肝转移癌（扩散至肝脏的癌症）。
经皮肝穿刺活检
经静脉肝活检
另一种操作称为经静脉肝活检，是将导管经颈静脉插入，通过心脏置入肝静脉，导管针经静脉壁刺入肝脏以获得肝组织。此法较经皮穿刺肝活检引起的损伤小些。它特别适用于无法正常凝血（一种严重的肝病并发症）的患者。
