革兰氏阴性菌按它们在使用称为革兰氏染色的化学方法后所变成的颜色分类。革兰氏阴性菌在使用此方法时变成红色。其他细菌染为蓝色。它们称作革兰氏阳性菌。革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌不同的染色是因为细菌细胞壁的构成不同。它们也会造成不同类型的感染，也需要应用不同类型的抗生素进行有效治疗。
革兰氏阴性菌被包裹在保护性的荚膜中。荚膜可以阻止白细胞（具有抗感染作用）吞噬细菌。革兰氏阴性菌的荚膜下面有一层外膜，可以帮助它们抵御某些抗生素（如青霉素）。外膜破裂时可以释放一种毒素，称为内毒素。内毒素是革兰氏氏阴性菌感染后出现严重症状的主要原因。
革兰氏阴性细菌感染包括以下这些：
革兰氏阴性菌正变得对抗生素越来越耐药。细菌可能因为以下原因变得耐药：
