脑部感染可能是由病毒、细菌、真菌或有时是原虫或寄生虫引起的。另一组被称为海绵状脑病的脑部疾病由被称为 朊病毒 朊蛋白病总览 朊蛋白病是罕见的进行性大脑退化性疾病，可以致命，并且目前无法治疗(很少情况下是其他器官的退化性疾病)，当一种蛋白质转变为一种被称为朊蛋白的异常形式时就会导致这种疾病。 在朊蛋白被发现之前，人们认为克雅氏病和其他海绵状脑病是由病毒感染引起。朊蛋白比病毒小很多，且不同于病毒、细菌和所有生命细胞，朊蛋白不... 阅读更多 的异常蛋白质引起。
脑部感染通常还与中枢神经系统的其他部分有关，包括脊髓。脑和脊髓都有很强的抗感染力，但一旦感染，后果非常严重。
感染可导致脑部炎症（脑炎 脑炎 脑炎是指脑部炎症，发生于病毒直接感染脑组织，或由病毒、疫苗、或其他因素触发的脑部炎症。脊髓也可受累，称为脑脊髓炎。 患者可出现发热、头痛、抽搐、也可能会感到嗜睡、麻木或精神恍惚。 常需做头部磁共振成像和腰穿检查。 治疗包括对症治疗和使用抗病毒药物。... 阅读更多 ）。病毒是脑炎的最常见原因。感染还会导致覆盖脑部和脊髓的组织层(脑膜)发炎——称为 脑膜炎 脑膜炎介绍 脑膜炎是包绕脑和脊髓的几层组织（脑脊膜）以及脑脊膜之间充满液体的腔隙（蛛网膜下腔）发炎。 脑膜炎可以由细菌、病毒或真菌、非感染疾病或药物引起。 脑膜炎的症状包括发烧、头痛和颈部僵硬，这使得下颏很难或无法接触胸部，尽管婴儿可能没有颈部僵硬，老年人和服用抑制免疫系统药物的人的症状可能不同。... 阅读更多 。细菌性脑膜炎通常会扩散到脑部本身，导致脑炎。病毒感染也导致脑炎，通常，这种感染也会引起脑膜炎。学术上，当脑和脑膜都被感染时，称作脑膜脑炎。然而，主要影响脑膜的感染通常称作脑膜炎，主要影响脑的感染通常称作脑炎。
在脑炎和脑膜炎中，通常感染不局限于一个区域。脑膜脑炎可出现在整个脑部、或遍布整个脊髓和脑的脑膜内。
但是在某些疾病中，感染局限于一个区域(局部)，即脓包，称为积脓或脓肿，这取决于它的位置：
真菌（例如 曲霉菌 曲霉菌病 曲霉菌病是由称为曲霉菌的真菌感染导致的一种疾病，通常累及肺部。 肺或窦道内可形成由真菌菌丝、血块及白细胞结成的球块。 可无症状或出现咳血、发热、胸痛和呼吸困难。 若真菌播散至肝或肾可导致相应器官功能障碍。 诊断方法通常包括 X线检查或计算机断层扫描，如有可能，也可对感染部位进行取样培养... 阅读更多 
）、原虫（例如 弓形虫 弓形体病 弓形虫病是由一种名叫刚地弓形虫的原虫引起的寄生虫感染。当人们在不知不觉中从猫粪中摄入弓形虫包囊或吃了被污染的肉类时，就会发生感染。通常，感染不会引起症状，但有些人会出现淋巴结肿大、发热、隐约不适，有时还出现咽喉痛、视物模糊和眼痛。在因艾滋病或其它疾病导致免疫系统受损的人中，弓形虫病可以... 阅读更多 ）和寄生虫（例如猪带绦虫、猪肉 绦虫 绦虫感染 肠道绦虫感染主要见于进食生的或未彻底煮熟的带虫猪肉、牛肉、淡水鱼，或者（对于矮绦虫而言）进食受污染的食物或水的人。 绦虫的成虫寄居在人的肠道内，通常不引起症状，但可以导致腹部不适、腹泻和体重下降。 猪肉绦虫也可在脑部及身体其它部位形成包囊（称作... 阅读更多 
）可能导致脑中形成囊肿。这些局部脑感染由一群被封闭在保护墙内的有机体组成。
有时脑部感染、疫苗、癌症或其他疾病会引发误导性免疫反应，导致免疫系统攻击脑部中的正常细胞(自身免疫反应 自身免疫性疾病 自身免疫病是机体免疫系统功能异常导致机体攻击自身组织的疾病。 尚不清楚自身免疫性疾病的触发因素。 症状根据疾病不同以及受累器官而各异。 自身免疫病的存在常需要一些血液检查来确定。 自身免疫病应用抑制免疫系统活性的药物治疗。 阅读更多 )。结果会导致脑部发炎。这种疾病被称为感染后脑炎。
细菌和其他传染性病原体可通过以下几种途径感染脑膜和脑组织：
血行感染
直接从外部进入大脑（例如，通过颅骨骨折或在脑部手术期间）
例如鼻窦和中耳等邻近部位感染扩散入颅
