Náusea, vômitos e diarreia são efeitos colaterais comuns de muitos medicamentos. Os responsáveis pelos problemas incluem

Além da diarreia associada a antibióticos, o uso de antibióticos pode causar diarreia induzida por Clostridium difficile.

O abuso de laxantes pode causar fraqueza, vômito, diarreia, perda de eletrólitos e outros distúrbios.

Reconhecer que um medicamento está causando gastroenterite pode ser difícil. Nos casos mais leves, o médico pode aconselhar a interrupção temporária do medicamento. Se os sintomas desaparecerem quando a pessoa interromper o uso de um medicamento e ressurgirem quando a pessoa volta a usá-lo, tal medicamento pode, então, ser a causa dos sintomas gastrointestinais. Nos casos de gastroenterite grave, o médico pode interromper o medicamento de forma definitiva.