A disfunção de certos pares cranianos pode afetar os olhos, as pupilas, os nervos ópticos, os músculos extrínsecos do bulbo ocular e seus nervos, e assim podem ser considerados transtornos dos pares cranianos, transtornos neuroftalmológicos ou ambos. As doenças neuroftalmológicas também podem envolver as vias centrais que controlam e integram os movimentos oculares e a visão. Doenças dos pares cranianos também podem envolver disfunções do olfato, visão, mastigação, sensibilidade ou expressão facial, gustação, audição equilíbrio, deglutição, fonação, virar a cabeça e elevar os ombros ou movimentos da língua (ver tabela Pares cranianos). Um ou mais pares cranianos podem ser afetados.