신체에는 보통 수백 여종의 박테리아가 서식하고 있으며, 각각의 박테리아 수만 계산해도 수조에 이릅니다.

대부분의 이 박테리아들은 다음에 상재합니다.

박테리아 종은 각 기생 부위마다 다르기 때문에 각 부위의 다양한 환경이 반영됩니다.

그 중 가장 일반적인 종의 박테리아는 생존과 증식에 산소가 필요하지 않은 혐기성 세균입니다.

보통 이 혐기성 세균들은 질환을 야기하지 않는 편입니다. 다수의 박테리아들은 장 내 음식물 분해를 돕는 등 유용한 기능을 수행합니다.

그러나 혐기성 박테리아는 점막이 손상될 경우 질환을 야기할 수 있습니다. 이 경우 조직은 박테리아 방어 기능을 상실한 상태가 되고, 박테리아는 평소에 접근이 제한되었던 조직에 침입할 수 있습니다. 박테리아는 구조(부비동, 중이, 폐, 뇌, 복부, 골반 및 피부) 주변을 감염시키거나 혈류에 침입하여 확산됩니다.