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消化器系に影響を及ぼす疾患を、消化器疾患といいます。消化器疾患には、消化器系の複数の個所に同時に起こるものもあれば、消化器系の一部分や1つの臓器だけに起こるものもあります。
以下のような一部の症状は、通常は何らかの消化器疾患を示唆しています。
腹痛(慢性腹痛と反復性腹痛も参照のこと)、放屁(おなら、食欲不振、しゃっくり、吐き気などのより一般的な症状があれば、消化器疾患や他の種類の病気も疑われることがあります。胸痛や背部痛があれば、通常は他の種類の病気が疑われますがときには、消化器疾患により発生することがあります。
「消化不良」という用語は、人によって異なる意味で使用される、あいまいな言葉です。ディスペプシア、吐き気と嘔吐、逆流、のどにしこりがある感覚(咽喉頭異常感)などの様々な症状を含んでいます。

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