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以下の疾患では、高気圧酸素治療が有益と考えられています。
空気塞栓症
クロストリジウム感染症（軟部組織の重い細菌感染症）
減圧症
放射線療法による骨の壊死（放射線性骨壊死）
治癒不良の皮膚移植
以下の疾患については、高気圧酸素治療が有効かどうかは明確ではなく、研究は今も行われています。
眼の網膜に血液を供給する太い動脈や静脈の閉塞
放線菌症により生じた脳膿瘍
「人喰いバクテリア」による感染症（壊死性筋膜炎）
失血による重度の貧血と極度の低血圧
重度の骨の感染症（骨髄炎）
重度の挫滅傷（通常は四肢のいずれかに発生したもの）
重度の熱傷（やけど）
重度の一酸化炭素中毒
放射線療法により生じた軟部組織の損傷
十分な血液供給が得られていない手足の傷
