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呼吸器感染症
細菌感染症（百日ぜき、ブドウ球菌［Staphylococcus］感染症、マイコプラズマ感染症など）
抗酸菌感染症（結核など）
ウイルス感染症（インフルエンザ、アデノウイルス感染症、RSウイルス感染症、麻疹［はしか］など）
気管支閉塞
異物の吸入
リンパ節の腫れ
肺腫瘍
肺の手術
粘液の栓（例えば、アレルギー性気管支肺アスペルギルス症によるもの）
吸入による損傷
有害な煙霧、ガス、または粒子による損傷
胃酸や食べもののかけらの吸引
遺伝性疾患
嚢胞性線維症
カルタゲナー症候群などの原発性線毛機能不全症
アルファ1‐アンチトリプシン欠乏症（重症の場合）
免疫学的異常
免疫グロブリン欠損症候群
白血球の機能障害
補体欠損症
関節リウマチ、シェーグレン症候群、潰瘍性大腸炎などの特定の自己免疫疾患
その他の病気
ヒト免疫不全ウイルス（HIV）感染症
びまん性汎細気管支炎（肺全体の細気管支の炎症と慢性副鼻腔炎を特徴とする）
