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男性であれば陰茎の先端、女性であれば尿道の開口部を、消毒剤を含ませた小さなガーゼでふいて清潔にします。
出はじめの数滴は採取せずにトイレに流すことで、尿道内の不純物を尿で洗い流します。
続いて排尿を再開し、尿のサンプルを滅菌済みのカップに採取します。通常は尿の流れが終わる前に採尿を終えます(中間尿)。