頸管粘液に異常があると、精子の子宮への進入が妨げられたり、精子が破壊されやすくなったりする可能性があります。
（不妊症の概要も参照のこと。）
頸管粘液は子宮頸部（子宮の下部で腟につながっている部分）の腺から分泌されます。通常、粘液は濃く排卵前までは精子は通れません。排卵直前になると、エストロゲンの血中濃度が上昇することで、この粘液が透明でよく伸びるようになります。すると精子は粘液を通過し、子宮を通って受精が起こる卵管へと入っていけるようになります。
粘液に異常があると、以下のような問題につながります。
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排卵時にも粘液の状態が変わらず（通常は感染症が原因）、妊娠の可能性が低くなる
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通常は子宮頸部の感染症（子宮頸管炎）を引き起こす腟内の細菌が子宮に侵入できるようになり、精子を破壊することがある
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粘液に精子に対する抗体が含まれている場合には、精子が卵子に到達する前に死んでしまう（この問題はまれ）
しかし、女性に慢性子宮頸管炎がある場合、あるいは子宮頸部の前がん状態（子宮頸部異形成）の治療により頸部が狭くなっている場合を除き、頸管粘液の問題により妊よう性が著しく損なわれるのはまれです。
