El tronco arterioso persistente se produce cuando, durante el desarrollo fetal, el tronco en desarrollo no se divide en la arteria pulmonar y la arteria aorta, lo que da lugar a un solo vaso sanguíneo de gran calibre que sale del corazón. Como resultado, la sangre que contiene oxígeno (sangre oxigenada) y sangre que no contiene oxígeno (sangre desoxigenada) se mezclan y penetran en el resto del cuerpo y los pulmones.