La ecocardiografía transesofágica puede indicarse cuando el médico necesita una mayor resolución o analizar la aorta y las estructuras de la parte posterior del corazón. Para llevar a cabo este procedimiento, se hace pasar un transductor por la garganta del afectado hacia el interior del esófago, de modo que el transductor quede situado justo detrás del corazón.