Die Gattung Salmonella ist in 2 Arten unterteilt, S. enterica und S. bongori, die > 2500 bekannte Serotypen umfassen. Einige dieser Serotypen haben Namen. In solchen Fällen wird der wissenschaftliche Name im allgemeinen Gebrauch manchmal verkürzt, indem nur die Gattung und der Serotyp angegeben werden; z. B. S. enterica, Unterart enterica, Serotyp Typhi, wird verkürzt zu Salmonella Typhi.
Salmonella können auch in 3 Gruppen unterteilt werden, basierend darauf, wie gut der Organismus an menschliche Wirte angepasst ist:
Hochgradig an den menschlichen Wirt adaptierte Serotypen und solche, die keine nonhumanen Wirte haben: zu dieser Gruppe gehören S. Typhi und S. Paratyphi A, B (auch genannt S. Schottmülleri) und C (auch genannt S. Hirschfeldii), die nur für den Menschen pathogen sind und häufig Typhus hervorrufen.
Diejenigen, die an nichtmenschliche Wirte adaptiert sind oder fast ausschließlich bei Tieren Krankheiten verursachen. Einige Stämme innerhalb dieser Gruppe—S. Dublin (Rinder), S. Arizonae (Reptilien) und S. choleraesuis (Schweine)—verursachen auch beim Menschen Krankheiten.
Serotypen mit einer Vielfalt an Wirten: zu dieser Gruppe gehören > 2000 Serotypen (z. B. S. Enteritidis, S. Typhimurium), die eine Salmonellen-Gastroenteritis hervorrufen können und für ca. 85% aller Salmonella-Infektionen in den USA verantwortlich sind.